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歸檔中電子文件的認定主要是指對其歸檔價值進行認定，確定保管期限，對積累的無保存價值的電子文件進行刪除并相應銷毀。這是為了確保歸檔電子文檔的準確性和完整性，并確定文件屬性。電子文件的檔案屬性主要體現在兩個方面：
首先，確定歸檔電子文檔的原創性、真實性和完整性。所謂原創性，即無論是形成的電子文檔還是之后由領導簽字認可的電子文檔；所謂準確性，即無論是產品定型的技術狀態，還是有交易處理和結果的電子文檔；完整性是指是否是一套完整的電子文件，背景信息和元數據是否完整。
二，確定電子文件的價值和保存期限。這主要取決于電子文件所包含的信息的社會價值和經濟價值以及社會對其的需求，從而確定其保存期限。這項工作主要是指紙質文件。
其主要任務是對已達到保存期限的歸檔電子文件進行重新審查和鑒定，對已失去保存價值的歸檔電子文件進行剔除和銷毀。這兩個階段的評估工作是相互關聯的。
電子文件在計算機、網絡等數字設備中生成和運行，電子文件的歸檔和管理也得要由計算機進行。利用紙質文件歸檔管理的方法和相關手段對電子文件進行歸檔管理，是一種認識上的誤區，在實踐中無法貫徹。實現電子文件歸檔管理的方式有兩種：一是在辦公自動化等業務系統設計之初，檔案人員就明確提出了電子文件歸檔管理的要求，在辦公自動化等業務系統中設置了電子文件歸檔管理的功能；二是開發專門用于電子文件歸檔管理的軟件系統，與單位業務系統聯動，實現電子文件歸檔管理。
